מקום לעצמו במהלך הגניזה והגילוי קובע ספר עץ חיים . בספר זה סידר ר' חיים ויטל את כל אשר שמע וקיבל מרבו האר"י , כמתואר להלן סעיף יז . בכל ימי חייו לא גילה ר' חיים ויטל את ספר עץ חיים וגם לא נתן לאיש לראותו . גם אחרי פטירתו לא יצא הספר מבית בנו ר' שמואל , אבל אז הותר למקובלים לבוא לביתו בדמשק ושם להסתכל בספר ולעיין בו מעט . מקובלים אחדים נסעו וראו את ספר עץ חיים וסיפרו על כך בהתרגשות , ואחרים שלא הצליחו להגיע לדמשק הביעו את תקוותם לראות את הספר בעתיד . כל אלה מבטאים את מעמדו המיוחד של ספר עץ חיים בעיני המקובלים . למעמד זה היו תוצאות חשובות , והן יתוארו בסעיף הבא . הסתרת הספר אחר שכתב ר' חיים ויטל את ספר עץ חיים הסתירו בביתו ולא הראה אותו לאיש . על כך סיפר ר' שלומיל מדרזניץ . וסידר כל הדברים כל דבר ודבר על מקומו הראוי לו , כי בשעה שלמדו לפני הרב לא למדו תמיד הדברים על הסדר ... ועשה מהן חיבור אחד נאה דבר דבור על אופניו , וחלק אותם לחלקים והחלקים לשערים והשערים לפרקים , וקרא אותן עץ החיים . והנה הוא גנוז אצלו ט"ו שנה , לא שזפתו עין רואי . אף על פי שהיה הספר גנוז ואיש לא ראהו תיארו ר' שלומיל ...
אל הספר