לאחר מפלת הצלבנים בקרני חיטין ( 1187 ) נפלה חברון לידי המוסלמים , מאז ועד הזמן החדש נמצאה המערה ברשותם . ( אמנם בשנת 1252 נחתם הסכם בין הנוצרים והמוסלמים כי השליטה על מערת המכפלה תעבור לידי הנוצרים , אך ההסכם לא יצא מעולם מהכוח אל הפועל . ( אף בשעה שהשלטון במקום היה בידי המוסלמים הוא עבר תכופות מיד ליד בין השליטים המוסלמים שמושבם בכרך מחר , לבין שליטי מצרים מאירך . לבסוף עבר השלטון לידי הממלוכים לצמיתות . השליט ביבארס ביצע במקום בניה ושיפוצים בשנת ; 1267 מניתוח המבנה נראה כי שינוים אלה לא היו מרחיקי לכת ביותר , לא התיחסו לעיקר המבנה , אלא למבנים הניספחים , ואולי לחלק העליון של קיר המתחם , אשר צורת הקרנלציה שלו מזכירה בניה דומה בגגות השערים בקהיר באותה תקופה . החל מתקופה זו הטילו המוסלמים את האיסור לאלה שאינם משתיכים לדתם להכנם למסגד . טרם שאיסור זה ניכנס לתוקפו הצליחו לבקר במקום שמואל בר שמעון ( 1210 ) וכן בורכרר , ( 1238 ) אלא שבשנת 1335 מעיד כבר הנוסע ג'ק מורונה , כי יכול היה להביע את התפעלותו מהמבנה רק מבחוץ , במאה החמש עשרה גברה קנאותם של שומרי המסגד , ואנו עדים לכך שמדריכי הצלינים...
אל הספר