79 חלוצ יות ב"חוכמת ישראל" הבדל שני בין הביוגרפיות של שני החוקרים נובע מהמבנה השונה שלהן ומקרין על תוכנן . בניגוד לביוגרפיה מאת צונץ, טקסט רציף שבשוליו מעט הערות קצרות, הביוגרפיות של שי"ר כללו טקסט מקדים, צנום, ממוקד ומהודק, וקובץ נלווה של הערות ארוכות . מבנה זה אִפשר לשי"ר להציג לא רק את מסקנותיו אלא גם את מהלך ליבון העניינים שהוביל לכל מסקנה, ואף להעמיק בדיון המחקרי בשורה של עניינים, הן פרטיים ביחס לגיבורי הביוגרפיות שלו הן כלליים . הבדל שלישי : אם צונץ תיקף אירועים על סמך השוואה בין מקורות שונים והעדפת מקור אחד על האחר, הרי ששי"ר נכנס לעומקם של המקורות ולא הסתפק בהעדפת אלו הסבירים יותר בעיניו . הוא גם קרא לתיקוני נוסח עקב שיבושים וחילופי אותיות, ואף הצביע על ההגהות הנחוצות כדי לתקף את חיי רס"ג באופן שיתאים ככל האפשר למסקנות העולות מסוגי המקורות השונים שעמדו לפניו . ההצבה של סימני שאלה על נוסחי הטקסטים של הכרוניקות היהודיות מימי הביניים הייתה גורם מפרה בזירת מדעי היהדות בראשיתה . סביר כי את הרגישות לתיקונים ולהגהות מעין אלה שאב לא רק מתלמידי חכמים יהודים שעוד בימי הביניים הציעו הגהות...
אל הספר