פרק שני [ 60 ] ר' אבא מארי מלוניל מציג את מערכת החכמות וסיווגן מתוך גישה חיובית . הוא מזהה את חכמת הטבע עם מעשה בראשית, ואת חכמת האלהות עם מעשה מרכבה, ונאמן בכך לשיטתו של הרמב"ם . לשתי מערכות עיוניות אלה יש מדרגות משניות, שהן החכמות המעשיות, כגון המתמטיקה, האסטרונומיה וההנדסה, שנועדו להביא תועלת לבני האדם, והדוגמה הבולטת לחכמות המעשיות היא הרפואה, שמכוחה ניתן לשמור את הבריאות ולרפא חוליים . מדרגות אלה מוליכות אל השלבים העליונים שבמעשה בראשית ומעשה מרכבה, ש"בהם יבחן האדם ציור המציאות וידע וישכיל קצת מפלאות ה' " . בשיאה של המערכת יגיע האדם לידיעת האל, "וידע ויכיר מי שאמר והיה העולם" . זו סנגוריה חד-משמעית על לימוד החכמות וראייתן כמוליכות למדרגה דתית גבוהה . מערכת זו היתה ידועה ומקובלת על חכמי התלמוד, כפי שהוא אומר בפרק השני : 128 [ פרק ב ] אין ספק כי החכמות כולם היו ידועות לחכמי תורתינו, והעד רבן יוחנן בן זכאי שהיה קטן מאותם שמונים תלמידים שהיו להלל הזקן, ואמרו עליו שלא הניח דבר גדול או קטן, מקרא ומשנה, תלמוד, הלכות והגדות, דבר קטן היינו הויות דאביי ורבא, 129 והן כל הבעיות והקושיות והתיר...
אל הספר